Hvordan virker HIV Resistance genetisk test arbejde?

18-09-2016 Nina Farry
FONT SIZE :
fontsize_dec
fontsize_inc

Selv for folk med perfekt tilslutning til terapi, forventes en vis modstand over for lægemidlet HIV at udvikle sig over tid på grund af naturlige mutationer af virus. I andre tilfælde kan modstanden udvikle sig hurtigt, når den ikke-optimale vedhæftning muliggør at HIV populationer resistente at trives, hvilket i sidste ende til svigt af behandlingen.

Når behandlingssvigt sker, skal alternative kombinationer af lægemidler vælges således, at undertrykke denne nye population af resistent virus.

Genetisk resistenstestning er med til at gøre dette lettere ved at identificere de typer af mutationer, modstandsdygtige over for en person "viral pool", mens fastslå, hvordan disse vira er modtagelige for mulige antiretrovirale midler.

To store værktøjer bruges til genetisk resistens test i HIV: HIV genotypiske og fænotypiske analyser hiv-testning.

Hvad er en genotype og fænotype?

Definition en genotype er simpelthen den genetiske sammensætning af en organisme, mens en fænotype er de observerbare egenskaber eller træk ved organismen.

Genotypisk test funktion ved at identificere de nedarvede instruktionerne i den genetiske kode af en celle, eller DNA. fænotypiske assays bekræfter ekspressionen af ​​sådanne udsagn under indflydelse af forskellige miljøforhold.

Mens sammenhængen mellem genotype og fænotype ikke er absolut, kan genotypebestemmelse ofte være prædiktive for fænotypen, navnlig når ændringer i den genetiske kode giver de forventede variationer af træk eller karakteristika, som i tilfældet med udviklingen af ​​resistens over for lægemidler.

Fænotypebestemmelse, på den anden side, bekræfter "her-og-nu". Den har til formål at vurdere virkningen af ​​en organisme til specifikke miljømæssige ændringer i tryk, såsom når HIV udsættes for forskellige lægemidler og / eller lægemiddelkoncentrationer.

Forklare genotypebestemmelse HIV

HIV genotypebestemmelse er generelt den mest almindelige teknologi, der anvendes for resistens test.

Formålet med testen er at identificere specifikke genetiske mutationer i gag-pol-regionen i virusgenomet «. Dette er den region, hvor revers transkriptase, protease og integrase-enzymer-mål for de fleste-antiretrovirale lægemidler er kodet på DNA-kæden.

Med forudgående amplifikation af HIV-genomet under anvendelse af polymerasekædereaktion-teknologi, laboranter i stand til at sekventere virussen ved anvendelse af forskellige genetisk mutation detektionsteknologier.

Specialer ændringer fortolkes af teknikere, der analyserer forholdet mellem mutationerne identificeret og "modtagelighed for virus omfatter flere antiretrovirale lægemidler. Onlinedatabasen kan hjælpe ved at sammenligne testsekvensen med den for et virus prototype "vildtype".

Fortolkningen af ​​disse tests anvendes til at bestemme lægemidlet følsomhed, med det største antal vigtige mutationer, som bibringer højere niveauer af resistens.

Forklare HIV Phenoytyping

fænotypebestemmelse HIV evaluerer væksten af ​​HIV person i nærvær af et lægemiddel, som sammenligner derefter, for væksten af ​​et virus kontrol, vildtype i samme lægemiddel.

Som med genotypiske assays, fænotypiske tests amplificere gag-pol-regionen i HIV-genomet. Denne del af den genetiske kode er derefter "sat" af en vildtype-klon under anvendelse af rekombinant DNA-teknologi. Det resulterende rekombinante virus bruges til at inficere pattedyrsceller in vitro.

Den virale prøve udsættes derefter for stigende koncentrationer af forskellige antiretrovirale stoffer op til 50% og 90% opnås viral suppression. Koncentrationer sammenlignes derefter med resultaterne af kontrollen, vildtype-prøve.

De relative ændringer "fold" give den værdi, interval, som narkotika følsomhed bestemmes. En ændring af fire gange betyder blot, at fire gange mængden af ​​lægemiddel var påkrævet for at opnå viral suppression sammenlignet med vildtype. Jo større den krølle værdi, mindre modtagelige for virusset er et specifikt lægemiddel.

Disse værdier placeres derefter inde i de nedre og kliniske større intervaller, med højere værdier giver de højeste niveauer af lægemiddelresistens.

Når en genetisk test modstand Udføres?

I USA, er den genetiske resistens test traditionelt udført på behandlingsnaive patienter at afgøre, om de har "erhvervet" lægemiddelresistens. Undersøgelser i patentet viser, at mellem 6% og 16% af det transmitterede virus vil være resistent over for mindst en antiretrovirale lægemidler, mens næsten 5% vil være resistente over for mere end én klasse af lægemidler.

Genetisk resistenstestning bruges også, når der er mistanke om resistens hos patienter i behandling. Testene udføres, mens patienten tager den svigtende regime eller inden for fire uger efter seponering af behandlingen, hvis den virale belastning er større end 500 kopier / ml. genotype test foretrækkes generelt i disse tilfælde, da de koster mindre, har en hurtigere behandlingstid, og at give en højere følsomhed til påvisning af blandinger af vildtype- og resistente virus.

En kombination af fænotypiske og genotypiske assays foretrækkes generelt til mennesker med komplekse, multiresistens, især for dem, der udsættes for proteasehæmmere.

World Health Organization. "Fact Sheet HIV resistens." Genève, Schweiz; April 11, 2011.

Kim, D .; Ziebell, R .; Saduvala, N .; et al. "Udviklingen i overførsel af HIV-1 ARV lægemiddelresistens forbundet med mutationer:. 10 HIV overvågning områder, USA, 2007-2010" 20. konference om Retrovira og opportunistiske infektioner. Atlanta, Georgia; 6 mar 2013; Oral Abstrakt 149.

National Institute of Health. "Retningslinjer for brug af antiretrovirale lægemidler i HIV-1-inficerede voksne og unge." Bethesda, Maryland; Oktober 11, 2013.